河海大学土木工程专业前身可追溯到1922年河海工程专门学校设立的“结构部”和“路工学部”。1924年,河海工程专门学校与东南大学工科合并成立河海工科大学,茅以升先生任校长,为河海大学土木学科发展奠定坚实基础。1984年开始形成完整的土木专业建制(时称工民建专业)。现为国家一流专业、国家一类特色专业、国家卓越工程师教育培养计划学科专业、国家级新工科研究与实践项目(首批)建设专业、江苏省首批品牌专业、江苏省重点专业类建设点。2017年第四次通过国家土木工程专业评估(认证)暨全国土木专业首轮工程教育专业认证。
河海大学交通工程专业始建于2000年,现为国家级新工科研究与实践项目(首批)建设专业、江苏省重点专业类专业、河海大学一流专业建设工程(I类)。借助国、省级专业类建设项目等平台,依托江苏省交通基础技术工程研究中心、交通运输部先进道路养护材料协同创新平台、交通虚拟仿真实验平台,从交通与道路两个方向培养特色鲜明的交通工程专业人才。2020年迎接国家工程教育专业认证专家组现场考察。